Почетокот на деведесеттите години претставува еден од најсудбоносните периоди во поновата македонска историја. Тогаш не се водеше само политичка битка за власт, туку суштински судир околу самото прашање: дали Македонија ќе стане целосно независна и суверена држава или ќе остане врзана за концептите и интересите на распаѓачка Југославија.
Во 1990 година Македонија влегува во нов политички систем и се одржуваат првите повеќепартиски парламентарни избори. Изборниот процес се одвиваше во три круга — на 11 ноември, 25 ноември и 9 декември 1990 година. На тие избори ВМРО-ДПМНЕ освои најмногу мандати, додека СКМ-ПДП остана втор најсилен политички фактор.
Но, поради тоа што ниту една партија немаше апсолутно мнозинство, како и поради тешките политички тензии поврзани со иднината на Југославија, беше формирана т.н. експертска влада.
На 20 март 1991 година, Никола Кљусев беше избран за претседател на првата влада во независна Македонија. Неговата влада остана запаметена како прва експертска влада што го водеше процесот на осамостојување и како влада во чие време беше организиран историскиот референдум на 8 септември 1991 година.
Токму во тој период најјасно се гледа разликата меѓу двата политички концепта што ќе ја одбележат македонската транзиција. Од едната страна ВМРО-ДПМНЕ беше со идејата за самостојна Македонија. Од другата страна стоеше концептот на тогашното СКМ-ПДП денес СДС, кое наместо јасна и недвосмислена поддршка за независност, се залагаше за зачувување на некаква „реформирана федерација“.
Тоа не беше случајно. Старите комунистички структури, израснати и формирани во рамките на југословенскиот комунистички систем, стравуваа од распадот на федерацијата и од губењето на политичката, економската и институционалната моќ. За нив, независна Македонија значеше и рушење на децениски воспоставени центри на влијание. Затоа, наместо целосно да застанат зад стремежот на народот за сопствена држава, тие често делуваа резервирано, неодлучно и со видлива политичка дистанца кон идејата за целосна независност.
Тој идеолошки и политички континуитет подоцна продолжи и низ трансформацијата на СКМ-ПДП во СДС. Иако се менува името, реториката и политичките околности, кај значителен дел од јавноста остана впечатокот дека суштинската матрица никогаш целосно не се променила, матрица во која националните прашања често се ставаат во втор план, а државните интереси се приспособуваат под надворешни политички притисоци.
Во годините што следуваа, Македонија се соочи со низа болни отстапки, договори и политички кризи кои кај многумина создадоа чувство дека државата постепено се оттурнува од темелите врз кои беше создадена.
Од спорот со името, преку историските и идентитетските отстапки, па сè до денешните притисоци поврзани со евроинтеграциите, повторно се отвора старото прашање: дали дел од политичките елити во СДС навистина веруваат во македонската државност како трајна и неприкосновена вредност, или ја гледаат само како привремена политичка форма што треба постојано да прави компромиси на сопствена штета.
Историјата покажува дека секоја генерација има свој момент кога мора да одлучи дали ќе ја брани државата или ќе ја релативизира. Деведесеттите беа токму таков момент. Народот тогаш избра независна Македонија. Но, политичкиот судир меѓу концептот на самостојна национална држава и концептот на постојани отстапки никогаш целосно не исчезна. Тој и денес е присутен, само во поинаква форма и под поинакви политички околности.
Затоа, кога денес се анализираат политиките на СКМ-ПДП и нивниот наследник СДС, не може тие да се разгледуваат изолирано од прашањето на македонската државност. Бидејќи токму таму, во односот кон независноста, идентитетот и националните интереси, се наоѓа суштината на политичката дебата што трае повеќе од три децении.